Zaman zaman Cloud’un içindeki Jenova hücrelerini kullanarak eski-ASKER’in karşısına çıkan Sephiroth, ailecek bir olmalarının vaktinin geldiğinin ve anneleri Jenova’nın yeniden hayat bulacağının mesajlarını vererek Cloud’u avucunun içine almayı amaçlıyordu. Cloud ve ekibini “Kadimler Tapınağı“nda karşılayan Sephiroth, burada kendi planını da açıklayarak Gaia’nın felaketinin çok yakın olduğunu söyledi. Siyah Materia isimli kristali kullanarak Gaia’yı en güçlü kara büyü olan devasa bir Meteor ile yaralamayı planlayan Sephiroth, dünyanın kendisini yeniden iyileştirmek için ortaya çıkaracağı Hayat Akımı ile de tanrı olacağını dile getirdi.
Her ne kadar Cloud ve ekibi Siyah Materia’ya ilk önce ulaşsalar da Cloud’un içerisindeki Jenova hücrelerini kontrol eden Sephiroth, dünyaya meteor indirebilen bu kristali aldı ve planını gerçekleştirmek için ortadan kayboldu. Cetra ırkının hayattaki son veliahtı olan Aerith Gainsborough ile Siyah Materia’yı durdurmak isteyen Cloud ve ekibi, yeryüzündeki en güçlü beyaz büyü olan “Kutsal“ı ortaya çıkararak meteoru durdurmayı amaçladılar. Aerith Kutsal’ı çağırmak için dua ettiği sırada Sephiroth, Jenova’nın bedenini kullanarak odachi’sini Cetra’nın son veliahtına sapladı; ancak Aerith’in masum ruhunun Hayat Akımı’na karışması ile Kutsal ortaya çıkarak meteoru durdurdu. Aerith’e karşı duygular besleyen ve kaybından dolayı kalbini keder saran Cloud ise dünyanın karşılaştığı en büyük tehlike olan Sephiroth’u durdurmak ve Siyah Materia’yı almak için tekrar yola koyuldu.
Kuzey Krateri’nde Jenova’nın vücudunu ele geçirmiş Sephiroth ile karşılaşan Cloud, nefretini ortaya koyarak bedeni yok etse de Sephiroth Nibelheim’da beş sene önce olan olayları göstererek, Cloud’un inancını kırmaya ve onu manipüle etmeye çalıştı. Cloud’un aslında sadece bir er olduğunu ve Jenova’nın hücrelerine sahip olarak yeni bir kimlik oluşturduğunu anlatan Sephiroth, Cloud’un Profesör Hojo tarafından yaratıldığını da söyledi. Jenova hücrelerinden oluşan bir bedene sahip olup Cloud isimli bir çocuğun hatırları ile yaşadığını söyleyen Sephiroth, kontrolü eline almak istedi. Ancak bu noktada Cloud’un çocukluk arkadaşı olan Tifa araya girerek onun küçüklüğünden beri Midgar’a gidip en başarılı ASKER olmak istediğini hatırlatmaya çalıştı.
Tifa’nın söylediklerine mi inanacağına yoksa Sephiroth’a mı güveneceğini bilemeyen Cloud, aklını yitererek Sephiroth’un kontrolü almasına izin verdi. Siyah Materia’yı yeniden Sephiroth’a veren Cloud, orada bilincini kaybetti ve Sephiroth’un tekrar göktaşını çağırmaya başlamasına sebep oldu. Elde ettiği Hayat Akımı ile bedenini mutasyona sokan ve formunu daha tanrısal bir şekle sokmaya çalışan Sephiroth göktaşını beklerken baygın hâldeki Cloud’u alan ekip, oradan uzaklaşarak güvenli bir yere gitti.
Shinra Şirketi tarafından güvence altına alınan Cloud ve ekibi, burada Sephiroth’u tamamen yok etmek için planlar kurarken Cloud ise geçmişini kabullenmiş ve çok daha güçlü birisi olarak kendini hazırlamıştı. Gaia’ya göktaşının çarpmasına az bir süre kala bu sahte tanrıyı tamamen yok etmek için yola çıkan ekip, Sephiroth’un yedi kanatlı tanrısal bedenine karşı savaşmaya başladı. Cloud’u yeniden kontrol etmeyi ve kendisi ile birleştirmeyi hedefleyen Sephiroth ise onun artık çok daha güçlü ve dayanıklı zihni ile karşılaştı. Hem beden hem de akıl olarak Cloud’a karşı mağlup olan Sephiroth, tamamen Hayat Akımı’na karışarak bedenini kaybetti ve Gaia’nın bir parçasına dönüştü. Sephiroth’un ortadan kalkmasıyla birlikte Aerith’in ortaya çıkarmaya çalıştığı ancak gücünün kontrol altında tutulduğu Kutsal isimli beyaz büyü de özgür kalarak Hayat Akımı’nı iyileştirdi ve Gaia’ya çarpmak üzere olan meteoru durdurdu.
“Ben..asla bir hatıra olmayacağım.”
Sephiroth her ne kadar bedenini Hayat Akımı’nda kaybetse de Jenova ile birleşmesinden ötürü zihni ile tamamen yok olmaya karşı koydu ve Gaia için bir tehdit olmaya devam etti. Hayat Akımı ile Gaia’ya Geostigma isimli hastalığı yaymaya çalışan Sephiroth, bu veba ile dayanıklılığı düşük ve Jenova hücresi taşıyan insanlara ulaşarak kendi formunu yeniden oluşturmayı denedi. Geostigmadan etkilenen insanlardan birisi de Cloud’du.
Tarihte Geostigma Krizi olarak anılan bu olay ile birçok çocuk hastalanmış ve Jenova’nın hücrelerine maruz kalarak Sephiroth için birer ‘kurbana’ dönüşmüştü. Bu sırada kendilerini Sephiroth’un inancının fiziksel formu olarak adlandıran ve anneleri Jenova’yı araştıran Kadaj, Loz ve Yazoo isimli üç platin saçlı kişi ise onun kalıntılarını bulmak için yola çıkmıştı. Ancak bu üç kurbanın bilmediği şey, bunu yaptıranın Sephiroth’un ta kendisi olmasıydı.
Kadaj’ın nihayetinde Jenova hücrelerine ulaşıp Sephiroth için yeterli bir kurban olmasıyla birlikte Gaia’nın tek kanatlı meleği yeniden hayat buldu. Cloud’a karşı beslediği nefretle ile yeniden harekete geçen Sephiroth, geostigma ile öldüreceği kişilerin ruhlarının Hayat Akımı’na karışacağını ve böylelikle gezegenin bizzat kendisini dahi yönetebileceğini iddia etti. Yeniden tanrı olmak için beden bulan ve bu sefer Cloud’u yok etmek isteyen Sephiroth, Midgar’ın yıkıntı binaları arasında kendisini birçok defa durduran düşmanıyla yüzleşti. Bu karşılaşma sırasında Zack, Aerith ve diğer arkadaşlarını hatırlayarak kaybetmemesi gerektiğinin farkına varan Cloud ise azimle savaşıp Sephiroth’u yok ederek onun yeniden Hayat Akımı’na karışmasına sebep oldu. Ancak bu sefer çoktan Hayat Akımı’na karışmış olan ve Gaia’nın iyileşmesinde en büyük rolü oynayan Aerith’in ruhu, geostigma ile dolan bu gezegeni iyileştirici yağmuru ile yıkadı. Bu yağmur ile Jenova hücrelerinin de tamamen yok olduğu ve Gaia’nın temizlendiği de bilim insanları tarafından kayıtlara geçirildi; öyle ki bu olaydan sonra tek bir Jenova hücresine bile rastlanmadı.
Shinra’nın hırsının bir kurbanı olan, ailesiz ve hatta kimsesiz yetişen Sephiroth aslen kötü biri değildi. Profesör Hojo’nun hırsının ve Shinra’nın güç açlığının kurbanı olarak büyüyen Sephiroth, hayatının her noktasında istemsizce yalnız kalarak zarar gördü. Angeal ve Genesis, ardından da Zack ve Cloud ile yaşadığı dostluklar, onu dünyaya ve yaşama gerçek anlamda bağlayan şeyler olsa da Hojo’nun yaptığı deneyler ve söylediği yalanlar Sephiroth’un kaderini belirledi. Sephiroth’un simsiyah kanatları ile gökten indiği, gözlerinin nefret ve intikamla dans ettiği anlar, Gaia’nın da tamamen temizlenmesine sebep oldu. Sephiroth insanların hırslarının, günahlarının ve yalanlarının tohumlarıyla hayat bulmuş, tek kanatlı bir melekti.
Şiddetli bir nefretle
Yanar içi
Şiddetli bir nefretle
Yanar içi
Sephiroth.
Kader – gaddar
Ve bomboş,
Kader – gaddar
Ve bomboş.
Gel, gel, gel kudretli olan
Ölmeme izin verme, görkemli olan.
Sephiroth.